O INCTI é gerido por um comitê gestor, constituído por cinco pesquisadores participantes do projeto.
Eduardo Batalha Viveiros de Castro - UFRJ - Museu Nacional (Vice-Coordenador)
Lattes: http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783546H3
Ilse Scherer-Warren - UFSC
Lattes: http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4727881Y1
José Jorge de Carvalho - UnB (Coordenador)
Lattes: http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787912J7
Kabengele Munanga - USP
Lattes: http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4721570H5
Marcelo Tragtenberg - UFSC
Lattes: http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4763756Z1